穿越吧主公的商店中有这样的5个模块分别是访贤玩法，也就是使用道具、元宝去搜寻各种武将，道具系统，可使用元宝去购买体力丹、精力丹、宝箱、招募令、经验书等，宝箱系统，可开启宝箱获得许多装备及珍贵道具，神秘商店系统，有一定的概率会得到武将、装备、消耗品，还有就是VIP礼包了。
访贤有三种方式：
山野遗贤：花费1个初级招将道具，可发现品质在白-橙之间的武将，
一方奇才：花费1个中级招将道具或100元宝，每天24小时有一次免费机会，可发现品质是绿-橙之间的武将
天下名士：花费1个高级招将道具或250元宝，每隔48小时有一次免费机会，冷却时间48小时，可发现品质在紫-橙之间的武将
关于宝物宝箱，需要钥匙才可开启宝箱，宝箱与钥匙分三档，金，银，铜宝箱和金，银，铜钥匙，有几率翻倍所获得的物品。